基因研究一直是農(nóng)作物科學(xué)領(lǐng)域的一大高地，基因測序工程集合了DNA聚合酶、納米技術(shù)、高性能計算等領(lǐng)域尖端科技，進(jìn)行農(nóng)作物全品種基因測序，對推動農(nóng)業(yè)發(fā)展、增加作物產(chǎn)量，起到關(guān)鍵作用。
然而，基因測序工程，動輒需要數(shù)萬/數(shù)十萬個基因測序及模型建立，需要大量的計算和存儲資源，常見的基因轉(zhuǎn)換、拼接、對比、注釋全流程，用一臺高性能服務(wù)器運行耗時30多個小時，數(shù)萬乃至十萬級的基因測序任務(wù)，對網(wǎng)絡(luò)、存儲、算力，以及業(yè)務(wù)響應(yīng)的及時性、可靠性、安全性有極高的要求。尤其是隨著第三代測序的推廣，在極大提升了測序準(zhǔn)確性的同時，對計算資源也需求增長了數(shù)百倍，自建數(shù)據(jù)中心進(jìn)行基因測序，在技術(shù)、建設(shè)周期和投資成本、運維成本上都面臨巨大的挑戰(zhàn)?！ ?/p>
華為云容器批量計算讓基因測序開足馬力
早在2018年，華為云就針對基因測序行業(yè)所面臨的困難，提供基于容器技術(shù)的解決方案，并發(fā)布了基因容器服務(wù)(Gene Container Service, GCS)。今年，綜合基因測序、AI、大數(shù)據(jù)、HPC等場景的共性訴求，華為云將基因容器全面升級容器批量計算服務(wù)(Batch Container Engine，BCE)，為基因測序提供更高效、更易用、極致性價比的解決方案。
容器批量計算服務(wù)基于云容器引擎(CCE)、云容器實例(CCI)、智能邊緣平臺(IEF)等基礎(chǔ)設(shè)施，提供多集群、多任務(wù)/異構(gòu)資源混合調(diào)度能力，并支持多隊列管理，讓多業(yè)務(wù)應(yīng)用規(guī)劃更便捷。相比于傳統(tǒng)批量任務(wù)處理方案，容器批量計算服務(wù)在性能、調(diào)度、運維、成本等方面都具備明顯優(yōu)勢：
·更高效 任務(wù)處理性能提升30%以上
面向容器/應(yīng)用的調(diào)度算法優(yōu)化，TPC-DS測試較原生K8s效率提升30%以上，調(diào)度性能1000 PODs/秒 ,業(yè)界平均水平的十倍，同時支持跨Region進(jìn)行資源調(diào)度，保障算力充足可用。
·更易用 開箱即用免運維
通過自動統(tǒng)一的資源管理，屏蔽復(fù)雜的環(huán)境依賴，用戶不用考慮環(huán)境維護(hù)成本，僅需要將精力專注在應(yīng)用本身，開箱即用，一處部署，處處可用。
·極致性價比 實現(xiàn)性能與成本的最佳平衡
基于容器技術(shù)，提供秒級彈性伸縮能力，擴(kuò)容速度可達(dá)30秒擴(kuò)容8000核，在流量突增時能快速彈性擴(kuò)容，保障業(yè)務(wù)的連續(xù)性和高穩(wěn)定性，通過按秒計費策略實現(xiàn)成本的精細(xì)化管理。
·豐富的硬件生態(tài) 滿足不同場景的差異化算力訴求
容器批量計算支持 X86、鯤鵬、昇騰、GPU等多樣化算力集群的混合部署，結(jié)合業(yè)務(wù)特點，靈活分配資源，同時支持推理流量多種分發(fā)策略，可使綜合成本降低30%。
華為云云原生高性能計算行業(yè)客戶首選
基于容器批量計算，華為云還推出了云原生高性能計算解決方案，并與生物、醫(yī)療等各行業(yè)知名廠商合作，形成面向不同細(xì)化領(lǐng)域的行業(yè)化解決方案：
·華大基因：云原生高性能計算解決方案為華大基因提供云端基因測序解決方案,通過對常用的軟件優(yōu)化,更好的支撐DNA、RNA、液態(tài)活檢等主流生物基因測序場景?！ ?/p>
·武漢希望組：利用三代測序優(yōu)勢，并采用5G傳輸、云原生高性能計算解決方案作為分析引擎和算力資源池，構(gòu)建全流程的病毒基因組實時分析平臺，適合在大范圍內(nèi)同時開展疫情的檢測工作。
·金橡醫(yī)學(xué)：基于云原生高性能計算解決方案打造的全容器基因測序解決方案，使得將有限的資金實現(xiàn)最大化利用，助力金橡醫(yī)學(xué)在市場上占得先機(jī)?！ ?/p>
·上海生科院：VIC(Virus Identification Cloud)得到云原生高性能計算解決方案強大計算能力的支持，可提供高通量多樣本并行云端分析能力，助力臨床診斷，還可監(jiān)測病毒變異趨勢。
華為云云原生高性能計算解決方案以應(yīng)用為中心，并基于華為云擎天架構(gòu)的深度軟硬協(xié)同能力，為業(yè)務(wù)提供多元算力、極致性能、極致體驗的云原生基礎(chǔ)設(shè)施，還再次升級了企業(yè)應(yīng)用架構(gòu)，統(tǒng)一企業(yè)在線與離線業(yè)務(wù)的運行平臺，簡化業(yè)務(wù)運維、提升資源利用率，進(jìn)一步加速了企業(yè)業(yè)務(wù)敏捷創(chuàng)新，目前已經(jīng)在AI、大數(shù)據(jù)、視頻轉(zhuǎn)碼等領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用。
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