本文來(lái)自微信公眾號(hào)“阿爾法公社”(ID:alphastartups),作者:發(fā)現(xiàn)非凡創(chuàng)業(yè)者的。
AI+生物醫(yī)藥領(lǐng)域,DeepMind的AlphaFold是最出名的研究,它幾乎完整解析了所有蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。AlphaFold的AI系統(tǒng)基于Transformer架構(gòu),而Transformer論文主要的作者Jakob Uszkoreit也已投身AI+醫(yī)藥領(lǐng)域。
Jakob Uszkoreit創(chuàng)立的AI生物技術(shù)公司Inceptive近日獲得a16z、NVIDIA的風(fēng)險(xiǎn)投資部門(mén)NVentures以及Obvious Ventures等機(jī)構(gòu)投資的1億美元A輪融資,加上此前融資的2000萬(wàn)美元,它的累計(jì)融資額達(dá)到1.2億美元,估值超過(guò)3億美元,比上一輪翻了兩番。
這筆融資使Inceptive獲得了NVIDIA尖端計(jì)算平臺(tái)的使用權(quán)限。在目前的芯片短缺情況下,計(jì)算能力越來(lái)越成為開(kāi)發(fā)復(fù)雜AI算法的限制因素。
與AlphaFold把目標(biāo)放到蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)不同,Inceptive的目標(biāo)是mRNA。它通過(guò)搭建一個(gè)AI軟件平臺(tái),去尋找和開(kāi)發(fā)mRNA分子,一旦這些分子通過(guò)了實(shí)驗(yàn)室的試驗(yàn),則會(huì)把這些分子授權(quán)給制藥公司進(jìn)行臨床試驗(yàn),最終變成基于mRNA的疫苗。
目前它已經(jīng)與一些歐洲的大型制藥公司合作,將這項(xiàng)創(chuàng)新的技術(shù)落地。
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Transformer論文作者與斯坦福教授用AI設(shè)計(jì)RNA分子
目前Transformer論文的8位作者都已離開(kāi)Google創(chuàng)業(yè),他們創(chuàng)立了Cohere,character.ai,AdeptAI,Essential AI以及Sakana.ai等,但是這些公司基本集中在ToC或ToB的文本處理相關(guān)的功能上,Jakob Uszkoreit的Inceptive是其中唯一跨界到生物醫(yī)藥,并且更偏向研究的,這是一個(gè)理想主義的創(chuàng)業(yè)方向。
Jakob Uszkoreit
“我們希望最大限度發(fā)揮AI在生命科學(xué)等領(lǐng)域的積極影響,尤其是生成式AI 在制藥行業(yè)的潛力。我們創(chuàng)辦的公司將會(huì)應(yīng)用生成式AI生成生物數(shù)據(jù),用于開(kāi)發(fā)新療法,而不是生成文本或者圖像。我們想最大化這種AI的積極影響。” Jakob Uszkoreit在談到自己的創(chuàng)業(yè)想法時(shí)表示。
大模型先驅(qū)+斯坦福生物教授+連續(xù)創(chuàng)業(yè)者
Inceptive由Jakob Uszkoreit(CEO)、Kevin Heyries(CBO)以及Rhiju Das于2021年聯(lián)合創(chuàng)立。
Jakob Uszkoreit從2008年起就在Google工作,他主導(dǎo)了Google Assistant的NLP團(tuán)隊(duì)。而他并不是在離開(kāi)Google創(chuàng)業(yè)時(shí)才選擇了AI+生物醫(yī)藥方向,在共同寫(xiě)作《Attention is all you need》這篇論文之前,他就已經(jīng)在探索將AI用于預(yù)測(cè)人類蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。
Rhiju Das是斯坦福大學(xué)生物化學(xué)與物理學(xué)副教授,他過(guò)往的研究一直集中在通過(guò)模擬和計(jì)算設(shè)計(jì)RNA分子,他主持著EteRNA大規(guī)模開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室,在2020年,Das及其團(tuán)隊(duì)利用EteRNA實(shí)驗(yàn)室的資源研究開(kāi)發(fā)了可常溫保存的COVID-19RNA疫苗。
Kevin Heyries曾是AI抗體發(fā)現(xiàn)公司AbCellera的聯(lián)合創(chuàng)始人,親自參與了AbCellera從組建到運(yùn)營(yíng)的多個(gè)方面,他在創(chuàng)新、業(yè)務(wù)拓展、商業(yè)策略、公司增長(zhǎng)等方面經(jīng)驗(yàn)豐富。
可以看出在這個(gè)創(chuàng)始團(tuán)隊(duì)中,Jakob懂AI,Rhiju Das懂生物和RNA,Kevin Heyries既懂技術(shù),又懂商業(yè),形成了很好的互補(bǔ)。
目前,Inceptive擁有一個(gè)由超過(guò)40位不同學(xué)科的專家組成的團(tuán)隊(duì),他們來(lái)自生物學(xué)、機(jī)器人和人工智能前沿專業(yè),新一輪的融資也將幫助Inceptive繼續(xù)擴(kuò)展團(tuán)隊(duì)規(guī)模,加強(qiáng)研發(fā)力量。
用AI設(shè)計(jì)mRNA
Inceptive的核心是一個(gè)能設(shè)計(jì)獨(dú)特mRNA序列的AI平臺(tái),這種“生物軟件”技術(shù)能夠在實(shí)驗(yàn)室中創(chuàng)建和測(cè)試新的分子結(jié)構(gòu)。
這個(gè)平臺(tái)運(yùn)行的原理是通過(guò)機(jī)器學(xué)習(xí)模型針對(duì)性地設(shè)計(jì)RNA序列,大大縮短藥物研發(fā)周期來(lái)降低研發(fā)成本, 它包括以下環(huán)節(jié):
1.開(kāi)發(fā)生物軟件,可以將編碼藥物或疫苗的程序代碼編譯成mRNA分子序列。
2.通過(guò)機(jī)器學(xué)習(xí)模型,自動(dòng)搜索和設(shè)計(jì)出優(yōu)化的RNA分子序列。
3.利用RNA的高效合成制造能夠表達(dá)疫苗或藥物的mRNA分子。
4.構(gòu)建RNA分子設(shè)計(jì)、合成、測(cè)試的自動(dòng)化閉環(huán)工作流程。
5.應(yīng)用該技術(shù)平臺(tái),快速開(kāi)發(fā)新藥和疫苗。
目前Inceptive已有310個(gè)試點(diǎn)項(xiàng)目分布在臨床前到臨床試驗(yàn)的各個(gè)階段,也已經(jīng)與一家歐洲大型制藥公司達(dá)成合作,共同作開(kāi)發(fā)一種新型傳染病mRNA疫苗。
Inceptive希望把計(jì)算機(jī)編程這個(gè)范式轉(zhuǎn)移到生物學(xué)領(lǐng)域,將軟件的精確性和模塊化引入理性設(shè)計(jì)分子中,利用AI工具合理設(shè)計(jì)出此前難以實(shí)現(xiàn)的新型療法,尤其關(guān)注基于mRNA的疫苗、藥物等新型藥物分子。
據(jù)Jakob Uszkoreit預(yù)估,在未來(lái)十年,將有大約700種基于mRNA的藥物。
AI在醫(yī)藥研發(fā)領(lǐng)域的拐點(diǎn)將在3年內(nèi)發(fā)生
盡管已經(jīng)累計(jì)獲得1.2億美元的融資,Inceptive仍然處于早期階段,它的技術(shù)平臺(tái)和產(chǎn)品保持了一定程度的低調(diào)。Jakob Uszkoreit在創(chuàng)業(yè)階段與一些硅谷投資人有過(guò)深度的交流,例如a16z生物+健康板塊的創(chuàng)始合伙人Vijay Pande,從對(duì)談中,可以一窺Jakob Uszkoreit這位大模型先驅(qū)者對(duì)于AI+生物醫(yī)藥的一些洞見(jiàn)。
Vijay Pande:真正為生物問(wèn)題明確開(kāi)發(fā)AI算法是非常罕見(jiàn)的,因?yàn)橐獡碛幸粋€(gè)既精通生物學(xué)又精通計(jì)算機(jī)科學(xué)領(lǐng)域的團(tuán)隊(duì)實(shí)在太困難了。但我很好奇聽(tīng)聽(tīng)你的看法,這個(gè)領(lǐng)域目前的關(guān)鍵挑戰(zhàn)是什么?
Jakob Uszkoreit:我遇到的關(guān)鍵挑戰(zhàn)是,在生物學(xué)領(lǐng)域還沒(méi)有大量的數(shù)據(jù),盡管現(xiàn)在的數(shù)據(jù)已經(jīng)比此前的數(shù)據(jù)更多更詳盡了。但是相比AI在其他領(lǐng)域的應(yīng)用,還是太少。
例如,在文字或圖片生成領(lǐng)域,數(shù)據(jù)可以直接從網(wǎng)絡(luò)爬取,深度學(xué)習(xí)專家對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行一些清洗,就可以直接用。而生物學(xué)領(lǐng)域卻不是這樣,它的數(shù)據(jù)生產(chǎn)更困難,我們需要不同的試驗(yàn)人員在不同的地方進(jìn)行很多的試驗(yàn)。深度學(xué)習(xí)專家無(wú)法自己獲取或掌握數(shù)據(jù)。
所以在這個(gè)領(lǐng)域需要有更多深度學(xué)習(xí)背景的人與生物學(xué)背景的人緊密合作,這樣當(dāng)他們互相了解了彼此的工作,就會(huì)有新嘗試和新方法誕生。
Vijay Pande:對(duì)于藥物設(shè)計(jì)、健康保健等方面,你認(rèn)為現(xiàn)在AI處于什么階段?還需要做什么?何時(shí)能夠達(dá)到預(yù)期的目標(biāo)?
Jakob Uszkoreit:雖然預(yù)測(cè)未來(lái)總是風(fēng)險(xiǎn)很高,我還是做一個(gè)預(yù)測(cè):如果在接下來(lái)的三年內(nèi)我們沒(méi)有看到機(jī)器學(xué)習(xí)和大規(guī)模深度學(xué)習(xí)在藥物研發(fā)、藥物設(shè)計(jì)方面產(chǎn)生實(shí)質(zhì)性影響的話,我會(huì)非常驚訝。最初的影響可能會(huì)出現(xiàn)在RNA、RNA療法和疫苗等領(lǐng)域,但這絕不會(huì)是唯一受到影響的領(lǐng)域,我認(rèn)為我們確實(shí)正走向一個(gè)拐點(diǎn)。
Vijay Pande:RNA有什么不同之處?是什么吸引你走向RNA研究,特別是從AI或ML的視角來(lái)看?
Jakob Uszkoreit:關(guān)于RNA有趣的一點(diǎn)是它具有很廣泛的適用性,雖然RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)并不真的很簡(jiǎn)單,但相比蛋白質(zhì)有20多種氨基酸的復(fù)雜結(jié)構(gòu),它只是一個(gè)具有四種不同基礎(chǔ)的生物聚合物,可以相對(duì)高效地生產(chǎn)。
Vijay Pande:是的,很有可能它是一個(gè)更快的反饋循環(huán)。
Jakob Uszkoreit:是的。鑒于我們需要?jiǎng)?chuàng)建大量的數(shù)據(jù)來(lái)訓(xùn)練模型,RNA似乎是目前為止在結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單性和合成可擴(kuò)展性方面最好的組合,這里有巨大的未開(kāi)發(fā)潛力。
Vijay Pande:是的,我認(rèn)為特別是有可能實(shí)現(xiàn)這種快速周期,無(wú)論是在臨床前階段還是更快地進(jìn)入臨床階段,并且在臨床階段停留的時(shí)間更短。
Jakob Uszkoreit:是的,這就是我們所期望的。我們也看到了一些初步的跡象表明這可能是事實(shí),這讓我們非常興奮。
在高需求和數(shù)據(jù)安全的邏輯下,必然誕生一批中國(guó)的AI+醫(yī)療公司
現(xiàn)在人們對(duì)于生成式AI的應(yīng)用方向主要集中在文生文,文生圖,文生視頻/3D等方向,應(yīng)用的落地領(lǐng)域包括傳媒,營(yíng)銷,法律,流程自動(dòng)化等。這個(gè)屬于生成式AI應(yīng)用的第一階段。
在下一階段,生成式AI將向更硬核的方向出發(fā),比如生成式AI+機(jī)器人,讓機(jī)器人變得更聰明,這既能用到制造業(yè),又能應(yīng)用到ToC;又比如生成式AI+科研,將大大加快科技發(fā)展的進(jìn)度,為人類整體帶來(lái)福利。
具體到AI+制藥,目前我們已經(jīng)看到兩種模式,一種是我們?cè)?jīng)報(bào)道過(guò)的Causaly,它的核心邏輯是幫助科學(xué)家減少dirtywork,從而加快科研的進(jìn)度。而本文的Inceptive則是直接作用于RNA分子,用AI來(lái)設(shè)計(jì)RNA,再與藥廠合作。
歡迎參考阿爾法公社關(guān)于Causaly的原創(chuàng)文章:將藥物研發(fā)速度提高10倍,Causaly獲6500萬(wàn)美元融資|AlphaFounders
不僅是生物醫(yī)藥的科研,Inceptive的主要投資人a16z認(rèn)為AI在醫(yī)療上也將大有發(fā)展。
AI在醫(yī)療上要解決兩大問(wèn)題,一個(gè)是降低前置診斷的成本(各種大模型都在刷醫(yī)療執(zhí)照考試的分?jǐn)?shù)),另一個(gè)是降低醫(yī)療保健系統(tǒng)里的人力成本。
解決的方式可能是幫助醫(yī)生預(yù)診斷,看X光片,醫(yī)療機(jī)器人等等。
盡管近年來(lái)中國(guó)的醫(yī)藥研發(fā)在加速,但是因?yàn)檠邪l(fā)上的后發(fā)劣勢(shì),以及研發(fā)投入規(guī)模較少(參考下圖),與美國(guó)的差距仍然巨大。不過(guò)AI+醫(yī)藥研發(fā)卻是一個(gè)可以?shī)^起直追的機(jī)會(huì)。一方面,中國(guó)的AI與美國(guó)在技術(shù)上并沒(méi)有代差,另一方面,醫(yī)藥研發(fā)需要大量的真實(shí)數(shù)據(jù),為了數(shù)據(jù)安全,中國(guó)需要自己的AI藥物研發(fā)系統(tǒng)。
圖片來(lái)自惠每科技的報(bào)告
對(duì)于醫(yī)療來(lái)說(shuō),邏輯也是一樣,為了數(shù)據(jù)安全(無(wú)論是哪一種行業(yè)的AI模型,都需要大量數(shù)據(jù)訓(xùn)練),本國(guó)的AI+醫(yī)療產(chǎn)品都十分重要。在需求,數(shù)據(jù)安全的邏輯下,很可能誕生一批中國(guó)本土的AI+藥物研發(fā)和AI+醫(yī)療健康創(chuàng)業(yè)公司,十分值得期待。
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